Peptidi koostuu lyhyestä aminohapposekvenssistä, jotka on yhdistetty peptidisidoksilla.
Peptidisynteesi on proteiini- ja peptidikemian aktiivinen ala, johon tyypillisesti liittyy aminohappojen peräkkäinen lisääminen määrätyssä järjestyksessä peptidiketjun muodostamiseksi kemiallisin menetelmin. Tärkeimmät synteesimenetelmät ovat nestefaasi- ja kiinteäfaasisynteesi. LPPS:ään verrattuna SPPS:n etuna on se, että se on nopeampi, yksinkertaisempi, sillä on vähemmän sivureaktioita ja suurempi saanto.
Vakio-SPPS-menetelmä, mukaan lukien Boc (bentsyyli ) ja Fmoc (tBu ) -strategiat.
Boc (bentsyyli) strategia
Tässä synteesilähestymistavassa kiinteinä kantajina käytetään kloorimetyloituja, hydroksimetyloituja polystyreeni- ja p-metoksibentsyyli (PMA) hartseja. -aminoryhmä suojataan t-butoksikarbonyylillä (Boc), kun taas aminohappojen sivuketjuryhmät suojataan bentsyylijohdannaisilla. Boc-ryhmä poistetaan käyttämällä puhdasta TFA:ta tai TFA:ta CH2Cl2:ssa, ja synteesin lopussa sivuketjun suojaryhmät ja peptidi-hartsisidokset poistetaan vahvalla hapolla, kuten vedettömällä fluorivetyhapolla (HF) tai TFMSA:lla.
Fmoc (tBu ) -strategia
Tässä synteesilähestymistavassa kiinteinä kantajina käytetään Wang-hartsia, 2-klooritrityylikloridihartsia, Rink-amidi-AM-hartsia, Rink-amidi-MBHA-hartseja. -aminoryhmä on suojattu 9-fluorenyylimetoksikarbonyylillä (Fmoc). ), kun taas aminohappojen sivuketjuryhmät on suojattu happolabiileilla suojaryhmillä. Fmoc-ryhmä poistetaan käyttämällä 20 % piperidiiniä DMF:ssä, ja synteesin lopussa sivuketjun suojaryhmät ja peptidi-hartsisidokset poistetaan 1 % -95 % TFA:lla. Fmoc SPPS on tällä hetkellä edullinen menetelmä peptidisynteesiin.